Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Slc38a11Q3USY0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Slc38a11Q3USY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms