Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc190Q3URK1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc190Q3URK1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms