Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQU0

Brd9, Bromodomain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd9Q3UQU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brd9Q3UQU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd9Q3UQU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms