Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrc1Q3UPH1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrc1Q3UPH1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms