Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cracr2aQ3UP38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cracr2aQ3UP38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms