Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nlrc4Q3UP24 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nlrc4Q3UP24 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms