Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem253Q3UNB8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem253Q3UNB8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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