Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cog7Q3UM29 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cog7Q3UM29 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cog7Q3UM29 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms