Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ell2Q3UKU1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ell2Q3UKU1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ell2Q3UKU1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ell2Q3UKU1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms