Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Mier3Q3UHF3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mier3Q3UHF3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mier3Q3UHF3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms