Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rrp36Q3UFY0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rrp36Q3UFY0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rrp36Q3UFY0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms