Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Rnf166Q3U9F6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rnf166Q3U9F6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Rnf166Q3U9F6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf166Q3U9F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Rnf166Q3U9F6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf166Q3U9F6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms