Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hectd3Q3U487 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hectd3Q3U487 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms