Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Otud5Q3U2S4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Otud5Q3U2S4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms