Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hace1Q3U0D9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hace1Q3U0D9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hace1Q3U0D9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms