Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pbxip1Q3TVI8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pbxip1Q3TVI8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pbxip1Q3TVI8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms