Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21440Q3TTD8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21440Q3TTD8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21440Q3TTD8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.2 ms