Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtf3c3Q3TMP1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms