Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Smarca4Q3TKT4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Smarca4Q3TKT4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Smarca4Q3TKT4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Smarca4Q3TKT4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms