Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nlrp4cQ3TKR3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nlrp4cQ3TKR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nlrp4cQ3TKR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms