Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms