Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vax1Q2NKI2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vax1Q2NKI2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms