Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3X8

Phactr1, Phosphatase and actin regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr1Q2M3X8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Phactr1Q2M3X8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phactr1Q2M3X8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phactr1Q2M3X8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms