Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Shroom4Q1W617 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Shroom4Q1W617 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Shroom4Q1W617 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
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Shroom4Q1W617 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Shroom4Q1W617 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Shroom4Q1W617 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
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Shroom4Q1W617 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
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Shroom4Q1W617 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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Shroom4Q1W617 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
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Shroom4Q1W617 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Shroom4Q1W617 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Shroom4Q1W617 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
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