Protein–RNA interactions for Protein: Q149M0

Clec12b, C-type lectin domain family 12 member B, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec12bQ149M0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clec12bQ149M0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec12bQ149M0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms