Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gli2Q0VGT2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gli2Q0VGT2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Gli2Q0VGT2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Gli2Q0VGT2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms