Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc162pQ0VG85 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc162pQ0VG85 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc162pQ0VG85 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms