Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lmntd2Q0VET5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmntd2Q0VET5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmntd2Q0VET5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms