Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rundc1Q0VDN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rundc1Q0VDN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rundc1Q0VDN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms