Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hif3aQ0VBL6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hif3aQ0VBL6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms