Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab42Q0PD08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab42Q0PD08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab42Q0PD08 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms