Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SobpQ0P5V2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SobpQ0P5V2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SobpQ0P5V2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms