Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cib3Q0P523 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cib3Q0P523 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms