Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrioQ0KL02 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TrioQ0KL02 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TrioQ0KL02 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms