Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ttc21bQ0HA38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ttc21bQ0HA38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ttc21bQ0HA38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ttc21bQ0HA38 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms