Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q08AU9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q08AU9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q08AU9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q08AU9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q08AU9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q08AU9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q08AU9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q08AU9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q08AU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q08AU9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q08AU9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q08AU9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms