Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tff1Q08423 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tff1Q08423 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms