Protein–RNA interactions for Protein: Q05BQ1

Igsf9, Protein turtle homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf9Q05BQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igsf9Q05BQ1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igsf9Q05BQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms