Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddr1Q03146 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ddr1Q03146 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddr1Q03146 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms