Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb1Q02819 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb1Q02819 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb1Q02819 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb1Q02819 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nucb1Q02819 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nucb1Q02819 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nucb1Q02819 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nucb1Q02819 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms