Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna1sQ02789 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1sQ02789 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1sQ02789 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna1sQ02789 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms