Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gjb5Q02739 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjb5Q02739 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms