Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ly9Q01965 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ly9Q01965 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly9Q01965 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms