Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VcpQ01853 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VcpQ01853 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VcpQ01853 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VcpQ01853 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VcpQ01853 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VcpQ01853 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VcpQ01853 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms