Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mc1rQ01727 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mc1rQ01727 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mc1rQ01727 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms