Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SelpQ01102 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SelpQ01102 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SelpQ01102 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelpQ01102 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelpQ01102 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelpQ01102 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SelpQ01102 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelpQ01102 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SelpQ01102 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms