Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Grin2bQ01097 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Grin2bQ01097 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Grin2bQ01097 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Grin2bQ01097 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms