Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VegfaQ00731 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VegfaQ00731 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VegfaQ00731 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms