Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Itga4Q00651 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itga4Q00651 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itga4Q00651 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms