Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stx2Q00262 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stx2Q00262 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms